核心發(fā)明專利獲得授權！集團免疫組庫測序就是這么6
2019-04-15 閱讀數：9657
近日，廣州華銀健康科技有限公司下屬子公司廣州華銀醫(yī)學檢驗中心自主研發(fā)的《基于分子標記的免疫組庫生物信息分析方法》發(fā)明專利獲得授權。一直以來，廣州華銀健康科技有限公司高通量測序事業(yè)部都專注于免疫組庫測序技術難題的攻克，該專利技術獲得授權，標志著廣州華銀健康科技有限公司在免疫組庫高通量測序產品研發(fā)上的重大突破，也標志著廣州華銀健康科技有限公司自主創(chuàng)新水平再上新臺階。
人類或哺乳動物的適應性免疫系統(tǒng)擁有大量的T細胞受體(TCRs)和B細胞受體(BCRs)，其總和統(tǒng)稱為免疫組庫。免疫組庫高通量測序技術允許對T或B細胞克隆進行深入分析，可以有效評估TCR/BCR互補決定區(qū)域(CDR3)的多樣性，并評估克隆類型的構成：包括特定克隆類型的比例;克隆之間的相似程度;V(D)J的基因使用頻率;核苷酸插入與缺失;CDR3區(qū)域長度分布等信息，為評估健康或疾病狀態(tài)下的機體適應性免疫系統(tǒng)提供了可能。
廣州華銀健康科技有限公司作為國內最早開展免疫組庫項目研發(fā)的團隊之一，早于2016年便與南方醫(yī)科大學（前第一軍醫(yī)大學）的科研團隊深度合作，并成功發(fā)表學術論文(Chen, et al. OncoImmunology (2016))。
此次廣州華銀健康科技有限公司推出的全新免疫組庫測序產品，其基于 5'RACE 的原理，在原始模板擴增前引入UMI序列進行文庫構建，并使用具有廣州華銀健康科技有限公司自主發(fā)明專利的UMI標記與校正算法(發(fā)明專利號：201810618023.7)，對PCR擴增與測序過程引入的錯誤與偏倚進行有效糾正，極大提高分析結果的準確度。
專利看點一：UMI減少錯誤與偏移
廣州華銀健康科技有限公司使用具有自主發(fā)明專利的UMI標記與校正算法技術，達到了75%以上的校正比(表1)，有效減少了測序和PCR擴增實驗過程中所引入的錯誤和偏移。
圖1. UMI標記消除測序和PCR擴增的錯誤
本項目所用的UMI(Unique Molecular Indices，分子條形碼)為16nt的隨機堿基短序列，可以看作分子條形碼。將隨機UMI序列于逆轉錄階段引入模板，標記原始樣本中的每個分子，對同一來源的擴增產物進行標記；通過UMI標記與校正算法，可以排除PCR擴增偏好性和建庫過程中造成的誤差，并獲取原始的轉錄本數量，達到絕對定量。
表1. 經過UMI算法校正后的部分測試數據校正比例統(tǒng)計表
專利看點二：重復性好，穩(wěn)定性高
廣州華銀健康科技有限公司使用具有自主發(fā)明專利的UMI標記與校正算法技術，發(fā)現在相同的RNA起始量下同一樣本其相關性高且重現性好(圖2)。
圖2. 同一樣本RNA起始量相同時樣本間的相關性圖
（起始RNA量：A1/A2/A3為1600ng; B1/B2/B3為400ng）
對于RNA起始量低或高的樣本，隨著測序深度的增加，均能夠快速達到測序平臺期，即數據量能夠滿足后續(xù)分析需求(圖3)。
圖3. 同一樣本RNA起始量不同時到達測序飽和期數據統(tǒng)計曲線圖
廣州華銀健康科技有限公司免疫組庫項目分析流程能夠對測序數據進行多維度深入挖掘(圖4)，給出最全面的數據分析報告，并可按照客戶的需求定制個性化分析服務。
圖4：數據分析條目概覽
廣州華銀健康科技有限公司免疫組庫項目部分分析結果展示
樣本的CDR3氨基酸長度分布圖
VJ Combination統(tǒng)計圖
樣本間VDJ基因共線性
樣本Rank abundance分布曲線圖
樣本Diversity分布曲線圖
